Opçaõ: Cobranças -> Quitar parcela -> Um a um
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Passos:

1. Na janela ´Quitar parcelas - Um a um´ selecione os campo para executar o pagamento
1.1. Campo ´Caixa fin.´
1.2. Campo ´Cód. aluno´
1.2.1. Neste campo você poderá inserir o nome do aluno diretamente ou fazer uma pesquisa no botão ao lado
1.2.1.1. Clicando neste botão aparecerá a janela ´Pesquisar aluno´, selecione o campo desejado para a pesquisa:
1.2.1.1.1. Campo ´Inicie com´
1.2.1.1.2. Campo ´Contenha´
1.2.1.1.3. Campo vazio para preenchimento.
1.2.1.2. Após ter selecionado os campos clique no botão ´Avançar´ 
1.2.1.3. Na janela seguinte ´Selecionar: Aluno Acadêmico´ procure pelo aluno (Ver <a href="abrir.php?txt=GER-Procurar registro em tabela.txt">GER-Procurar registro em tabela</a>)
1.3. Campo ´Cód. parcela´
1.3.1. Neste campo você poderá inserir o codigo do tipo de parcela diretamente ou fazer uma pesquisa no botão ao lado
1.3.1.1. Clicando no botão de pesquisa aparecerá a janela ´Selecionar: Parcela de cobrança´, clique duas vezes na parcela desejada ou selecione o campo da parcela e clique no botão ´Selecionar´
1.3.1.2. Clicando no outro botão ao lado ´<quantidade> débitos de <valor>´ aparecerá a janela ´Débitos finaceiros em <Ano>´ clique duas vezes em um dos campos ou selecione o campo e clique no botão ´Confirmar´
1.4. Campo ´Diferença de pagamentos anteriores´
1.5. Campo ´Vencimento´
1.6. Campo ´Hoje´
1.7. Campo ´Val. principal´
1.8. Campo ´Val. corrigido´
1.9. Campo ´Pagamento´
1.10. Campo ´Val. a pagar´ (será habilitado caso ´Pagamento´ seja preenchido)
1.11. Campo ´Val. real pago´ (será habilitado caso ´Pagamento´ seja preenchido)
1.12. Campo ´Diferença´ (será habilitado caso ´Pagamento´ seja preenchido)
1.13. Campo ´Emitir comprovante de pagamento´ (desabilitado mas selecionado por padrão)
1.14. Campo ´Eliminar quitação do sistema´ (desabilitado)
2. Para concluir o pagamento clique no botão ´Efetivar pagamento´ ou para cancelar a operção clique no botão ´Fechar´